そんな質問を思いつく、そこにシビれる!あこがれるゥ!

涼宮ハルヒのスカートが短い理由を説明してくださいって…「キャラデザのいとうのいぢに聞け」じゃダメですかそうですか。
…まあ、それと変わらないくらい見も蓋も無い答えになるけど「それが一般的な女子高校生としての記号だから」ってのが無難な気が。例えば、マリみてみたいなロングスカート制服は淑女の記号、ガンダムカラーのトリコロールはヒーローの記号、デモンベインのカリグラみたいなマッチョ敵は雑魚キャラの記号とか何とかそんな感じで。って最後のは一体何なんだ自分。